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Après la guerre, Lincoln a proclamé que le gouvernement devait être de forme républicaine et reconnaître la liberté permanente des esclaves, cela ne leur a pas donné de vote. Lincoln a publié une politique de reconstruction et a utilisé ses pouvoirs de grâce présidentielle pour permettre à tous les Sudistes, à l'exception de certains hauts fonctionnaires, de se réintégrer en prêtant serment de fidélité à l'Union. Lincoln a annoncé son « plan des dix pour cent », qui permettrait aux États rebelles d'envoyer des représentants au Congrès.
De nombreux républicains ont refusé de siéger les représentants. Ces républicains étaient des abolitionnistes en colère contre Lincoln pour ne pas avoir agi contre l'esclavage, au début de la guerre. Les républicains radicaux ont adopté le projet de loi Wade-Davis exigeant un serment d'allégeance des États faisant sécession avant que la reconstruction puisse commencer. Lincoln a exercé un veto de poche. Lorsque Lee se rendit à Appomatox, Lincoln se dirigeait vers un accord avec les républicains radicaux pour une reconstruction de l'Union.