Sí, independientemente de si respondió a su tweet inicialmente o no, la gente siempre podrá enviarle mensajes directamente usando su cuenta de Twitter.
Solo hay dos casos en los que las cosas pueden complicarse:
1) Si su cuenta está bloqueada para que sus tweets estén protegidos.
Solo las personas a las que hayas aprobado para seguirte pueden ver tus tweets. Entonces, si la persona a la que acaba de responder no está en su lista de seguidores, no habrían visto su respuesta.
2) Mensajes directos.
Si estás siguiendo a alguien, pueden enviarte un mensaje directo (o DM). Pero para responder, ¡deben estar siguiéndote de vuelta!
Espero que esto ayude.