Sí, los enlaces de afiliados se cuentan en los backlinks si son dofollow. Si son nofollow, no contarán y no pasarán el link juice.
Cualquier enlace dofollow que apunte a un dominio cuenta como un vínculo de retroceso y también se incluyen los enlaces de afiliados.
Si necesita más vínculos de retroceso a su sitio web, creo que es mejor no perder el tiempo tratando de resolver las cosas usted mismo, sino subcontratar la tarea a https://linklifting.com/, por ejemplo. Esos muchachos saben exactamente qué hacer, por lo que obtendrá un buen resultado a un precio razonable.