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Enfermedades de las plantas: los
hongos son responsables de muchas enfermedades porque producen varias enzimas que pueden degradar la celulosa, la lignina e incluso la cutícula. Todas las plantas son susceptibles a ellos.
Los extensos daños debidos a las royas y las enfermedades del carbón del trigo, el maíz y el arroz provocaron el desplazamiento masivo y el hambre hasta la muerte de muchas personas.
El mildiú polvoroso, el cornezuelo del centeno, la pudrición roja de la caña de azúcar, la marchitez de la papa, la pudrición de la raíz del algodón, la sarna de la manzana y la podredumbre parda de los melocotones, ciruelas, albaricoques y cerezas son algunas otras enfermedades comunes de las plantas causadas por hongos.
Enfermedades animales: los
hongos también causan ciertas enfermedades animales. El gusano del anillo y el pie de atleta son infecciones fúngicas superficiales causadas por ciertos hongos imperfectos.
Candidiasis o candidosis: la levadura causa aftas orales y vaginales.
La histoplasmosis es una infección grave de los pulmones causada por la inhalación de esporas de hongos que es común en suelos contaminados con heces de aves.
La aspergilosis es causada por Aspergillus fumigatus, pero solo en persona con un sistema inmunológico defectuoso como el SIDA y muchos causan la muerte.
Aflatoxinas: algunas cepas de Aspergillus flavus producen una de las micotoxinas más cancerígenas llamadas aflatoxinas.